Il Master Universitario di secondo livello in “Bioinformatica: Applicazioni biomediche e farmaceutiche” è un corso di alta formazione permanente e ricorrente di durata annuale, istituito a partire dal 2002 presso il Dipartimento di Scienze Biochimiche “A. Rossi Fanelli” per studenti e operatori in possesso del titolo di laurea specialistica conferito dalle Facoltà di Scienze MM.FF.NN, Farmacia e Medicina, Medicina e Psicologia, Medicina e Odontoiatria, ovvero di altro titolo di studio, anche conseguito all’estero, riconosciuto idoneo.

Il Master si propone di formare personale competente nell'utilizzo di tecniche bioinformatiche, per l'applicazione in laboratori di ricerca del settore farmaceutico e biotecnologico.

Il profilo-tipo dello studente che può probabilmente trarre maggiore vantaggio dalla frequenza del Master è rappresentato da un individuo con una sufficiente base di conoscenza di chimica biologica e biologia molecolare eventualmente già inserito in un contesto lavorativo di ricerca o di produzione in ambito biomedico, farmaceutico o biotecnologico. Questo profilo non è ovviamente esclusivo della tipologia di studente che può frequentare il Master con profitto e vantaggio.

 

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La quota di iscrizione ammonta a 2000,00 Euro. Sono previste a seconda della disponibilità, borse di studio il cui importo atteso è confrontabile con la quota di iscrizione. Il Master può essere attivato solo se saranno iscritti almeno 10 studenti. Sono ammessi al massimo 15 studenti. Ulteriori dettagli saranno riportati nel bando.

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Organizzazione del Master

Didattica

Il Master è articolato in due semestri, approssimativamente da dicembre a metà marzo e da aprile a giugno. Nel primo semestre sono previste prevalentemente lezioni ed esercitazioni pratiche su argomenti di base e propedeutici (programmazione, statistica, algoritmi, chimica biologica, biologia molecolare) insieme a materie più prettamente bioinformatiche. Il secondo semestre è dedicato prevalentemente alle materie più propriamente bioinformatiche che prevedono frequenti sessioni di laboratorio. L'attività didattica sarà concentrata e presumibilmente limitata al giovedì e venerdì pomeriggio (ore 14-20). In ogni caso, il calendario delle lezioni verrà concordato tenendo presente il più possibile le esigenze degli studenti. La frequenza ai corsi è obbligatoria

Tirocini

Il conseguimento del titolo del Master è subordinato allo svolgimento di un tirocinio pratico presso laboratori universitari o laboratori di istituti di ricerca pubblici e privati, eventualmente indicati dallo studente stesso, al termine del quale il candidato presenta un breve elaborato scritto. Il tirocinio ha tipicamente una durata compresa tra due e otto settimane. Alternativamente, il tirocinio può essere sostituito da un periodo di approfondimento assistito individuale su un argomento trattato durante il Master, al termine del quale il candidato presenterà comunque un breve elaborato scritto.

Nelle scorse edizioni, le seguenti strutture hanno ospitato studenti del Master per lo svolgimento del tirocinio finale:

• Dipartimento di Scienze Biochimiche, "La Sapienza", Roma (Prof. Pascarella, Prof. Tramontano)
• Dipartimento di Chimica, "La Sapienza", Roma (Prof. Di Nola)
• Dipartimento di Biologia, "Tor Vergata", Roma (Prof. Helmer-Citterich)
• Dipartimento di Biologia, Univ. Bologna (Prof. Casadio)
• IRBM, Pomezia (Dr. Koch, Dr. Lahm, Dr. De Rinaldis)
• Istituto per le Applicazioni della Matematica, Napoli (Dr. Amato)
• CNBI, Njemegen, NL (Prof. Vriend)
• CASPUR, Roma (Dr. Castrignanò, Dr. Sanna)
• TIGEM, Napoli (Dr. Di Bernardo)
• CMBI, Madrid (Prof. Valencia)
• CEINGE, Napoli (Prof. Paolella)

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Obiettivi formativi

Competenze acquisite Il corso di studi permetterà l’acquisizione delle competenze necessarie per: • Analizzare con strumenti bioinformatici le sequenze e strutture nucleotidiche e proteiche. • Interrogare efficacemente le banche dati biologiche. • Utilizzare metodi di predizione per localizzazione di geni in genomi, la struttura secondaria, terziaria e quaternaria di macromolecole, la loro funzione e le loro interazioni, progettazione di farmaci. • Utilizzare correttamente metodi di simulazione energetica di strutture di molecole biologiche. • Sviluppare ed utilizzare metodi di analisi di dati funzionali di genomica e proteomica.

Materie previste   Struttura, funzione, evoluzione delle proteine Struttura, funzione e regolazione del genoma Statistica con laboratorio Programmazione e algoritmi per la bioinformatica con laboratorio Banche dati biologici con laboratorio Analisi di sequenze e strutture di proteine con laboratorio Previsione di strutture proteiche con laboratorio Fondamenti di meccanica e dinamica molecolare con laboratorio Docking, drug design e virtual screening con laboratorio Analisi genomiche con laboratorio System biology e metabolomica con laboratorio Annotazione funzionale delle proteine Ricostruzione filogenetica Trascrittomica Moduli specialistici